Cephalon begann 1997 seine Aktivitäten in Deutschland und Österreich als pharmazeutisches Unternehmen, das sich auf Erkrankungen des zentralen Nervensystems und auf die Schmerztherapie spezialisiert hatte.
Durch die Akquisition von Zeneus Pharma, eines pan-europäischen onkologischen Unternehmens, erweiterte Cephalon 2005 sein Betätigungsfeld auf die Onkologie. 
Die deutsche Tochtergesellschaft, die Cephalon GmbH, beschäftigt derzeit 100 Mitarbeiter und agiert im pharmazeutischen Markt mit einem Portfolio zur Behandlung lebensbedrohender Erkrankungen im Bereich der Onkologie und Hämatologie, sowie der Schmerztherapie, der Neurologie und Schlafmedizin.